Муниципальное образование расположено в сухом, жарком агроклиматическом подрайоне. В целом по всей территории климат характеризуется холодной зимой и жарким летом, с наличием большого количества восточных и северо-восточных ветров.
Граница муниципального образования «Кочковатский сельсовет» идет от русла реки Ахтуба в северо-восточном направлении протяженностью 850 м до орошаемого участка «Спицына Грива». Далее граница идет в северном направлении, вдоль орошаемого участка «Спицына Грива» протяженностью 950 м до ерика Лопатин, затем по середине ерика Лопатин протяженностью 2300 м, далее в северо-восточном направлении протяженностью 11150 м.
Далее граница идет в северо-западном направлении протяженностью 1380 м до орошаемого участка «Овощной», затем в северо-западном направлении протяженностью 3900 м по середине ерика «Поперечный», затем в северо-восточном направлении протяженностью 4150 м по водооградительному валу орошаемого участка «Придорожный» до сбросной насосной станции, далее в северном направлении протяженностью 700 м вдоль сбросного канала до оросительной насосной станции.
Далее граница идет протяженностью 2200 м до озера Длинное, затем идет в северном направлении через озеро Длинное, по суходолу протяженностью 2000 м до автомобильной дороги Астрахань — Волгоград. Далее в северо-восточном направлении протяженностью 800 м до лесополосы бывшего Управления лесного хозяйства Харабалинского района, далее через железную дорогу Москва — Астрахань протяженностью 3450 м.
Далее граница идет в северо-восточном направлении через пески Ялмань и пески Шубгурские протяженностью 14380 м до урочища «Колодец Ельчанинов», далее в северном направлении протяженностью 3692 м до урочища «Пески Малента», затем в восточном направлении протяженностью 5500 м до границы с Республикой Казахстан.
Далее граница идет от урочища «Пески Найлол» протяженностью 17500 м через урочище «Пески Хаватак» до урочища «Пески Ашкулук», далее граница идет в западном направлении протяженностью 5000 м до участка «Хамта», затем в южном направлении протяженностью 4000 м до границы земель Богдинской опытной станции. Далее граница идет в западном направлении вдоль железной дороги Москва — Астрахань протяженностью 2000 м, затем в юго-восточном направлении, пересекая железную дорогу Москва — Астрахань протяженностью 4500 м, далее граница идет в западном направлении протяженностью 600 м.
Далее граница проходит вдоль автомобильной дороги Астрахань — Волгоград протяженностью 3500 м, затем протяженностью 5000 м идет до Кардонных озер. Затем граница идет вдоль озер в южном направлении до орошаемого участка «Послеспадовый» и далее в западном направлении вдоль орошаемого участка «Послеспадовый» до границы участка «Кряж». Далее проходит по середине реки Ашулук протяженностью 3000 м, затем в юго-западном направлении протяженностью 7000 м и далее протяженностью 6000 м в северо-западном направлении до орошаемого участка «Филимонов угол».
Далее граница идет в северном направлении по середине реки Ахтуба протяженностью 14000 м до реки Парашкина, а затем по середине реки Парашкина до первоначальной точки.